Институт «Экономики, информационных технологий и профессионального образования», созданный в 1963 году, является одним из старейших подразделений университета. Первым деканом института был к.э.н., доцент А.А.Конкин (1963-1965). В год организации института принято 45 студентов по специальности «Экономика и организация сельского хозяйства» и 55 студентов по специальности «Агроэкономика». Начиная с 1964 года, велась подготовка кадров по специальности «Бухгалтерский учет в сельском хозяйстве».
Много энергии, знаний и труда вложили в становление и развитие института деканы: X.К.Кенжегулов (1965-1969), Р.Х.Мясоутов (1969-1971, 1972-1974), Б.Х.Хаиров (1971-1972), Б.Г.Гумаров (1974-1978), Ш.Б.Ермеккалиев (1978-1988), А.Г.Тастемиров (1988-1990,1992-1996), Б.Т.Толебаева (1990-1992), С.И.Мендалиева (1996-1998), А.Ш.Шамгонов (1993-2003 г.г. возглавил факультет «Учет и аудит»), Р.Сатканова (1998-2000), М.А.Мансурова (2000-2003), И.В.Богдашкина (2003-2005), А.А.Айдаралиева (2005-2007, 2009), А.Д.Ибыжанова (2007-2009), Р.С.Габдуалиева (2010-2015), А.М.Казамбаева (2015-2020). Сегодня институт возглавляет доцент, кандидат экономических наук Ержанова Жанар Куттыкбаевна.
Весомый вклад в становление института внесли руководители высших школ: Х.К.Кенжегулов, Б.Г.Гумаров, Е.Х.Гиззатов, Н.Н.Солоха, A.M.Воронова, К.Г.Ахметов, Б.К.Джумашев, Б.Т.Толебаева, П.В.Ковель, А.Ш.Шамгонов, А.П.Вишневская, Б.Г.Искакова, А.Д.Исмагулов, Н.Д.Вишневский, М.А.Мансурова, С.Ж.Жаксыгалиева, Е.Г.Габдрахманов, Р.Г.Сатканова, Т.Н.Траисова, А.Н.Бурахта, Б.С.Есеналиев, С.Х.Бисенов, А.У.Султанов, Н.Н.Пащенко.
В институте создается мощная многоотраслевая научная группа, способная эффективно ответить на любой вызов трансформирующейся инновационной экономики. Преподаватели института занимаются научно-исследовательской работой. В высших школах ведется работа по 3 научным темам. Преподаватели по результатам участия в международных, республиканских, региональных и университетских научно-практических конференциях ежегодно занимают призовые места. Высшие школы института сотрудничают с республиканскими и региональными органами по разработке различных программ на договорной основе.
Наши выпускники сегодня работают как на предприятиях пищевой и перерабатывающей отрасли, так и в других отраслях, разных структурах бизнеса, в сфере услуг, банках, органах государственного управления, налоговых органах и так далее. Вместе с этим полученная специальность дает возможность преподавать экономические дисциплины в вузах и колледжах Казахстана, успешно трудиться в научно-исследовательских и проектных институтах.