1. Отобрать образцы биологического материала для проведения молекулярно-генетических исследований;

2. Выделить ДНК из отобранного биоматериала, оценка качественных и количественных показателей выделенного ДНК-материала;

3. Создание банка-депозитария для хранения биоматериала и ДНК сайгаков;

4. Проведение SNP – генотипирования с широким покрытием генома представителей дикой популяции и содержащихся в неволе сайгаков;

5. Обработка результатов SNP-генотипирования (контроль качества и фильтрация SNP-маркеров, отбор полиморфных SNP);

6. Секвенирование митохондриального генома и изучение эволюционного вектора, выявление редких и значимых мутаций в кодирующих генах;

7. Оценка генетического разнообразия и степени генетической дифференциации казахстанских популяций Saiga tatarica tatarica;

8. Разработка рекомендаций, направленных на сохранение генофонда казахстанских популяций Saiga tatarica tatarica.

Банк-депозитарий за отчетный период пополнен образцами найденного биоматериала устюртской популяции сайгаков и полученным ДНК-материалом. Результаты секвенирования были выравнены на референсный геном Saiga tatarica, который содержит около 2,9 миллиарда пар оснований, собранных в 1772199 скаффолдов без аннотаций. Количество прочтений, полученных для каждого образца, варьировалось от 99 554 798 до 214 952 300. Из этих данных от 96,45% до 98,43% прочтений было успешно выравнено на референсный геном. Наиболее частой заменой является A>G, а транзиции преобладают над трансверсиями (соотношение ≈ 2.18). Общая длина митохондриального генома составляет ~16,300 пар оснований, что указывает на сохранение размера митохондриального генома. Распределение кодирующих последовательностей (CDS) одинаковы и занимает большую часть внешнего кольца в обоих геномах. Области с высоким и низким содержанием GC, демонстрируют похожие паттерны, что свидетельствует о консервативности общей структуры генома. Проанализированные образцы демонстрируют в целом высокую генетическую схожесть относительно друг друга на основе митохондриальных геномов. Однако присутствие генетического расстояния, в изучаемых образцах, может указывать на неоднородную структуру популяции или географическую вариацию.

В результате проделанной работы будут получены следующие результаты:

1. Будет проведено SNP – генотипирование с широким покрытием генома;

2. Выполнена обработка результатов SNP-генотипирования;

3. Будет проведено секвенирование митохондриального генома, изучен эволюционный вектор, выявлены редкие и значимые мутации в кодирующих генах;

4.Будет проведена оценка генетического разнообразия и степени генетической дифференциации казахстанских популяций Saiga tatarica tatarica;

5. Будут разработаны рекомендации, направленные на сохранение генофонда казахстанских популяций Saiga tatarica tatarica.

Степень внедрения: –

Сравнение эффективности методов выделения днк из биологического материала сайгаков / Ульянов В.А., Шәмшідін Ә.С., Бейшова И.С., Тлеуленов Ж.М., Ульянова Т.В., Сидарова А.Ж., Абылгазинова А.Т., Ковальчук А.М., Гинаятов Н.С., Кырыкбаева Е.Э. // Ғылым және білім, г.Уральск. – 2023. – Т.1 – № 3 (72). – С. 145-160. https://doi.org/10.52578/2305-9397-2023-3-1-144-159.
Оценка применения коммерческого микрочипа для SNP-генотипирования сайгака (Saiga tatarica tatarica) с целью определения генетической структуры / Ульянов В.А., Сидарова А.Ж., Бейшова И.С., Кужебаева У.Ж., Гинаятов Н.С. // Ғылым және білім, г.Уральск. – 2024. – Т.1 – № 3 (76). – С. 20-32. https://doi.org/10.52578/2305-9397-2024-3-1-20-32

• Перечень товаров, работ и услуг, планируемых к закупу для научных исследований в 2025 году AP19577569 Ульянов В.А.
• Уточненный перечень товаров,работ и услуг по проекту AP19577569 от 03.03.2025 г
• Уточненный перечень товаорв, работ и услуг по проекту АР19577569 от 31.07.2025г