Название проекта / программы:
AP19680057 «Изучение хозяйственно-полезных признаков и характеристика генофонда крупного рогатого скота казахской белоголовой породы методом ресеквенирования и транскриптомного анализа».

Основная информация

Наименование темы проекта / программы: AP19680057 «Изучение хозяйственно-полезных признаков и характеристика генофонда крупного рогатого скота казахской белоголовой породы методом ресеквенирования и транскриптомного анализа»

Наименование приоритетного направления развития науки, по которому подается заявка. 6. Наука о жизни и здоровье.

Наименование специализированного научного направления исследований: 6.2 Инновационные биологические исследования для повышения продуктивности и устойчивости сортов растений и пород животных в сельском хозяйстве.

Научный руководитель проекта/программы: Ульянова Т.В., PhD

Период реализации, его продолжительность в месяцах. 01.02.2023 г. – 31.12.2025 г., 35 месяцев.

Общий объем финансирования, и по годам: 99 350,0 тыс. тенге:

2023 г. – 27 750,0 тыс. тенге; 

2024 г. – 35 800,0 тыс. тенге;

2025 г. – 35 800,0 тыс. тенге.

Объекты исследования, разработки или проектирования: Крупный рогатый скот казахской белоголовой породы

Цель проекта / программы: проведение ресеквенирования и транскриптомного анализа крупного рогатого скота казахской белоголовой породы, разводимой в Республике Казахстан, характеристика генофонда, выявление конкретных генетических вариантов под давлением отбора, ассоциированных с хозяйственно-полезными признаками.

Задачи проекта / программы

1. Отбор и описание выборки казахской белоголовой породы и отбор биологического материала;

2. Полногеномное ресеквенирование перспективных особей и биоинформатическая обработка данных;

3. Анализ индекса гетерозиготности в геномах казахской белоголовой породы с другими породами;

4. Выявление SNP полиморфизмов, INDEL полиморфизмов, CNV индекса и структурных вариаций в геноме казахской белоголовой породы;

5. Выявление информативных вариантов генома, ответственных за хозяйственно-полезные признаки;

6. Определение информативных полиморфизмов и создание генетической базы данных вариаций казахской белоголовой породы;

7. Определение информативных профилей miRNA у казахской белоголовой породы;

8. Разработка научно-обоснованных методических предложений, позволяющих оценивать состояние генофонда, сохранять и улучшать генетическое разнообразие крупного рогатого скота казахской белоголовой породы.

Полученные результаты и новизна

Сформирована экспериментальная группа крупного рогатого скота казахской белоголовой породы в количестве 15 быков (Западно-Казахстанская область, Бокейординский район, село Бурли) и отобран биоматериал от животных. Получены в общей сложности 903459044 прочтений, из которых 895309555 были успешно картированы на референсный геном, согласно критериям контроля качества секвенирования. В результате проведенного исследования было установлено, что ожидаемая и наблюдаемая гетерозиготность казахской белоголовой породы составили 0.402 и 0.398, соответственно. В геноме казахской белоголовой породы крупного рогатого скота были идентифицированы вставки и делеции (INDEL), размеры которых варьировались от 1 до 61 пар оснований.В результате исследования было охарактеризовано 21707 варианта, из которых 9935 (45.8%) оказались новыми, а 11772 (54.2%) соответствовали ранее известным вариантам. Большая часть обнаруженных вариантов (55%) располагалась в интронных областях генов, что является характерным для многих видов организмов. Среди вариантов, расположенных в кодирующих областях генов, 55% составляли missense-мутации, которые могут изменять структуру и функцию белков, и 41% — это синонимичные замены, не влияющие на аминокислотную последовательность.
Степень внедрения: Результаты исследований станут основой для разработки программ разведения и эффективного управления селекционным процессом в мясном скотоводстве, сохранения и совершенствования генетических ресурсов с целью социально-экономического развития в масштабах Республики Казахстан.

Ожидаемые результаты

Будут идентифицированы в геноме полиморфизмы и гены, участвующие в формировании хозяйственно-полезных признаков казахской белоголовой породы, найдены и рекомендованы к использованию в селекции конкретные генетические варианты. Будут выявлены уникальные профилей транскрипции miRNA у казахской белоголовой породы. В конечном итоге будут разработаны рекомендации по оценке генетического потенциала, а также сохранению и совершенствованию генетических ресурсов казахской белоголовой породы.

Список публикаций по проекту

1 Ульянова Т.В., Бейшова И.С., Шәмшідін Ә.С, Ковальчук А.М., Кулбаев Р.М, Бейшов Р.С. Ресеквенирование полного генома крупного рогатого скота казахской белоголовой породы / Научно-практический журнал ЗКАТУ имени Жангир хана «Ғылым және Білім». – 2024. – №3-2 (76). – С.130-140. https://doi.org/10.52578/2305-9397-2024-3-2-130-140

📚 Loading…