Основная информация
Наименование темы проекта / программы: АР19577616 «Изучение породоспецифичных признаков у отечественных пород лошадей методом ресеквенирования и транскриптомного анализа».
Наименование приоритетного направления развития науки, по которому подается заявка. 6. Наука о жизни и здоровье.
Наименование специализированного научного направления исследований: 6.2 Инновационные биологические исследования для повышения продуктивности и устойчивости сортов растений и пород животных в сельском хозяйстве.
Научный руководитель проекта/программы: Бейшова И.С., доктор биологических наук, ассоциированный профессор
Период реализации, его продолжительность в месяцах. 1.02.2023-31.12.2025 г.г., 35 месяцев
Общий объем финансирования, и по годам: 75 000,00 тыс.тг,
2023 год – 25 000,00 тыс.тг;
2024 год – 25 000,00 тыс.тг;
2025 год – 25 000,00 тыс.тг.
Объекты исследования, разработки или проектирования: Отечественные породы лошадей (мугалжар, кушум, казахская порода: джабе, найманский и адайский типы)
Цель проекта / программы: Ресеквенировать полный геном отечественных пород лошадей (мугалжар, кушум, казахская порода: джабе, найманский и адайский типы), выявить конкретные генетические варианты под давлением отбора и провести поиск породоспецифических участков генома для повышения генетического потенциала животных, раннего прогнозирования их племенной ценности, сохранения и совершенствования генетических ресурсов.
1. Сформировать выборку исследуемых групп отечественных пород лошадей
2. Провести ресеквенирование полного генома и его биоинформатический анализ
3. Провести сравнение распределения гетерозиготности в геномах отечественных пород лошадей с другими породами
4. Определить одиночные нуклеотидные полиморфизмы (SNP), вставки/делеции (INDEL), вариации числа копий (CNV), структурные вариации (SV) в геноме исследуемых групп отечественных пород лошадей
5. Установить возможные функциональные варианты последовательности генома, ответственные за определенный фенотип
6. Выявить уникальные или специфические генетические варианты и создать базу данных геномных вариаций отечественных пород лошадей
7. Выявление уникальных профилей транскрипции miRNA у разных отечественных пород лошадей
8. Разработать рекомендации по оценке генетического потенциала отечественных пород лошадей, раннему прогнозированию их племенной ценности, сохранению и совершенствованию генетических ресурсов
Проведено ресеквенирование полного генома отечественных пород лошадей и его биоинформатический анализ.Проведено сравнение распределения гетерозиготности в геномах отечественных пород лошадей с другими породами.Определены одиночные нуклеотидные полиморфизмы (SNP), вставки/делеции (INDEL), вариации числа копий (CNV), структурные вариации (SV) в геноме исследуемых групп отечественных пород лошадей.Установлены возможные функциональные варианты последовательности генома, ответственных за определенный фенотип. Выявлено, что распределение гетерозиготности у отечественных пород более вариабельно между различными участками генома, в то время как у зарубежных пород гетерозиготность распределена более равномерно. Обнаружены SNP, INDEL, CNV и SV которые могут быть связаны с различиями в фенотипических характеристиках и здоровье лошадей. Анализ генетических вариантов в геномах отечественных пород лошадей выявил значительное количество мутаций, как известных, так и новых. Эти варианты оказывают влияние на разнообразные биологические процессы, включая рост, развитие, иммунный ответ и метаболизм. Обнаруженные SNP, INDEL и структурные вариации могут быть использованы для улучшения селекционных программ и повышения устойчивости животных к заболеваниям.
В результате реализации проекта будет:
– сформирована выборка исследуемых групп отечественных пород лошадей
– проведено ресеквенирование полного генома и его биоинформатический анализ
– проведено сравнение распределения гетерозиготности в геномах отечественных пород лошадей с другими породами
– определены одиночные нуклеотидные полиморфизмы (SNP), вставки/делеции (INDEL), вариации числа копий (CNV), структурные вариации (SV) в геноме исследуемых групп отечественных пород лошадей
– установлены возможные функциональные варианты последовательности генома, ответственные за определенный фенотип
– выявлены уникальные или специфические генетические варианты и создана база данных геномных вариаций отечественных пород лошадей
– выявлены уникальные профили транскрипции miRNA у разных отечественных пород лошадей
– разработана рекомендация по оценке генетического потенциала отечественных пород лошадей, раннему прогнозированию их племенной ценности, сохранению и совершенствованию генетических ресурсов.
Степень внедрения: Данные исследования позволят создать перспективные разработки для планирования селекционной работы, программ по разведению отечественных пород лошадей.
1. Бейшова И.С., Шәмшідін Ә.С, Кужебаева У.Ж., Ульянов В.А., Ульянова Т.В., Бекова Г.С., Салимова Д.К. Формирование выборки и отбор отечественных пород лошадей для проведения полногеномного ресеквенирования / Научно-практический журнал ЗКАТУ имени Жангир хана «Ғылым және Білім». – 2024. – №3-2 (76). – С.140-149. DOI 10.52578/2305-9397-2024-3-2-140-149
- ➣Перечень товаров, работ и услуг, планируемых к закупу для научных исследований в 2025 году АР19577616 Бейшова И.С.
- ➣Уточненный перечень товаров,работ и услуг по проекту АР19577616 от 03.03.2025 г
- ➣Уточненный перечень товаров,работ и услуг, планируемых к закупу для исследований в 2025 году по проекту АР19577616 от 11.04.2025
- ➣Уточненный перечнь товаров,работ и услуг по проекту AP19577616 от 27.05.2025г
- Уточненный перечень товаров, работ и услуг по проекту АР19577616 от 02.10.2025